Настойка софоры применяется при заболеваниях, связанных с нарушением проницаемости сосудов (кровоизлияниях в сетчатку глаза, внутренних и маточных кровотечениях, геморрагическом диатезе). Применяют её и для профилактики кровоизлияний, при атеросклерозе, геморрое, повышенном артериальном давлении, различных проблемах с сердцем.
Препараты софоры обладают также ранозаживляющими свойствами, ускоряют регенерацию тканей (благодаря свойству уменьшать проницаемость и хрупкость капилляров), повышают способность организма усваивать аскорбиновую кислоту. Доказано активное бактерицидное действие в отношении золотистого стафилококка и кишечной палочки, поэтому она с успехом применяется при язве желудка и двенадцатиперстной кишки, начальной стадии туберкулёза лёгких, парапроктите, дизентерии.
Софора японская обладает успокаивающим и противовоспалительным действием, борется с вирусными инфекциями в крови, вызывающими различные кожные и системные заболевания. Благодаря этим свойствам настойка софоры способна оказать помощь при сепсисе, ревматизме, тромбофлебите, инфекционных заболеваниях желудка и двенадцатиперстной кишки, язвенном колите, гломерулонефрите, аллергии. За счёт сильных кровоочистительных свойств софора улучшает состояние кожи при псориазе и экземе, применяется также при вульгарной угревой сыпи и красной волчанке, способствует обновлению формулы крови после отравлений и длительного приёма синтетических лекарств и антибиотиков.